Die Gründung des Klosters geht auf das Jahr 1095 zurück. Während des Konflikts zwischen Papst und Kaiser (13. Jh.), den Appenzellerkriegen (15. Jh.) und dem Schwedenkrieg (17. Jh.) wird es mitunter schwer in Mitleidenschaft gezogen. 1806 wird die damalige Benediktinerabtei Mehrerau von der Bayerischen Regierung aufgelöst.
«4 in einem Boot»
1854 wird das ehemalige Kloster von Zisterziensermönchen aus Wettingen erworben, die dem Kloster – und ihrem Orden – in der darauffolgenden Jahren zu neuem Glanz verhelfen.
Internat und Fussball-Akademie
Neben dem Kloster unterhält die Zisterzienserabtei Wettingen-Mehrerau auch ein Internat, das sogenannte Collegium Bernardi. Bis vor kurzem stand das Internat nur für Jungen offen, ab Herbst nimmt es erstmals auch Mädchen auf.
Eher weltlich geht es auch in der Fussball-Akademie des Klosters zu – so mancher Bundesliga-Star hat hier seine Karriere begonnen. Und während der Sommerzeit werden die Internatsräumlichkeiten auch an Gäste vermietet.